VEnCode
latest
Contents:
Getting Started
Main Tools
VEnCode
»
Index
Edit on GitHub
Index
A
|
B
|
C
|
D
|
E
|
F
|
G
|
K
|
L
|
M
|
N
|
R
|
S
|
T
|
V
A
add_celltype() (VEnCode.internals.DataTpm method)
(VEnCode.internals.DataTpmFantom5 method)
algorithm (VEnCode.internals.Vencodes attribute)
B
binarize_data() (VEnCode.internals.DataTpm method)
C
copy() (VEnCode.internals.DataTpm method)
D
data (VEnCode.internals.DataTpm attribute)
(VEnCode.internals.DataTpmFantom5 attribute)
(VEnCode.internals.Vencodes attribute)
data_type (VEnCode.internals.DataTpmFantom5 attribute)
DataTpm (class in VEnCode.internals)
DataTpmFantom5 (class in VEnCode.internals)
define_non_target_celltypes_inactivity() (VEnCode.internals.DataTpm method)
determine_e_values() (VEnCode.internals.Vencodes method)
,
[1]
drop_target_ctp() (VEnCode.internals.DataTpm method)
E
e_values (VEnCode.internals.Vencodes attribute)
export() (VEnCode.internals.Vencodes method)
F
filter_by_reg_element_sparseness() (VEnCode.internals.DataTpm method)
filter_by_target_celltype_activity() (VEnCode.internals.DataTpm method)
G
get_vencode_data() (VEnCode.internals.Vencodes method)
K
k (VEnCode.internals.Vencodes attribute)
L
load_data() (VEnCode.internals.DataTpm method)
,
[1]
M
make_data_celltype_specific() (VEnCode.internals.DataTpm method)
,
[1]
(VEnCode.internals.DataTpmFantom5 method)
,
[1]
merge_donors_primary() (VEnCode.internals.DataTpmFantom5 method)
merge_reg_elements() (VEnCode.internals.DataTpm method)
merge_replicates() (VEnCode.internals.DataTpm method)
module
VEnCode.internals
,
[1]
,
[2]
N
next() (VEnCode.internals.Vencodes method)
,
[1]
next_heuristic2_vencode() (VEnCode.internals.Vencodes method)
R
remove_celltype() (VEnCode.internals.DataTpm method)
(VEnCode.internals.DataTpmFantom5 method)
remove_element() (VEnCode.internals.DataTpm method)
S
sample_type (VEnCode.internals.DataTpmFantom5 attribute)
shape (VEnCode.internals.DataTpm attribute)
(VEnCode.internals.DataTpmFantom5 attribute)
shape() (VEnCode.internals.DataTpm property)
sort_columns() (VEnCode.internals.DataTpm method)
sort_sparseness() (VEnCode.internals.DataTpm method)
T
target (VEnCode.internals.DataTpm attribute)
(VEnCode.internals.DataTpmFantom5 attribute)
target_replicates (VEnCode.internals.DataTpm attribute)
(VEnCode.internals.DataTpmFantom5 attribute)
(VEnCode.internals.Vencodes attribute)
target_replicates_data (VEnCode.internals.Vencodes attribute)
to_csv() (VEnCode.internals.DataTpm method)
V
VEnCode.internals
module
,
[1]
,
[2]
vencode_mc_simulation() (VEnCode.internals.Vencodes static method)
Vencodes (class in VEnCode.internals)
vencodes (VEnCode.internals.Vencodes attribute)
view_vencodes() (VEnCode.internals.Vencodes method)
Read the Docs
v: latest
Versions
latest
Downloads
On Read the Docs
Project Home
Builds